Après mise à jour du serveur SQL, il est possible d'obtenir cette erreur au redémarrage physique (boot) du serveur :

error: 'Can't connect to local MySQL server through socket '/var/run/mysqld/mysqld.sock' (2)' — Missing /var/run/mysqld/mysqld.sock

Il se trouve que systemd lance bien le service mysql qui est donc démarré mais ne semble pas pouvoir être en mesure de créer son fichier sock. Il va donc falloir l'aider:

On crée un nouveau fichier pour systemd:

nano /etc/tmpfiles.d/mysql.conf

et on y ajoute ce code qui va permettre de chmoder et chowner le répertoire /var/run/mysqld pour l'utilisateur mysql:

# systemd tmpfile settings for mysql
# See tmpfiles.d(5) for details

d /var/run/mysqld 0755 mysql mysql -

Cela règle le problème définivement.

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